Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CLPPQ16740 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLPPQ16740 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLPPQ16740 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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