Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNXAQ16473 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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