Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ATP6AP1Q15904 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.5 ms