Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPRKQ15262 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.6 ms