Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RAB3GAP1Q15042 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RAB3GAP1Q15042 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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