Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CUL1Q13616 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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