Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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SNX1Q13596 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SNX1Q13596 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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SNX1Q13596 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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