Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXC5Q00444 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXC5Q00444 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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HOXC5Q00444 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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