Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ACTBP60709 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ACTBP60709 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ACTBP60709 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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ACTBP60709 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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ACTBP60709 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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ACTBP60709 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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ACTBP60709 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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ACTBP60709 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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ACTBP60709 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ACTBP60709 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ACTBP60709 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ACTBP60709 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ACTBP60709 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ACTBP60709 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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ACTBP60709 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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ACTBP60709 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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ACTBP60709 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACTBP60709 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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