Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Speer3W4VSP1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms