Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top3bQ9Z321 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms