Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac5Q9Z2V6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac5Q9Z2V6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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