Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Knop1Q9Z2Q2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms