Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms