Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Crlf3Q9Z2L7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms