Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd4Q9Z2D7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd4Q9Z2D7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms