Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upk1bQ9Z2C6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upk1bQ9Z2C6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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