Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tulp1Q9Z273 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tulp1Q9Z273 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms