Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn7Q9Z261 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn7Q9Z261 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms