Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx39bQ9Z1N5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms