Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Oc90Q9Z0L3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Oc90Q9Z0L3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Oc90Q9Z0L3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Oc90Q9Z0L3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Oc90Q9Z0L3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Oc90Q9Z0L3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Oc90Q9Z0L3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Oc90Q9Z0L3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Oc90Q9Z0L3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Oc90Q9Z0L3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms