Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0K8

Vnn1, Pantetheinase, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn1Q9Z0K8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vnn1Q9Z0K8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms