Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clcn5Q9WVD4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms