Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nme4Q9WV84 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms