Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp1a4Q9WV27 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms