Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scnn1bQ9WU38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scnn1bQ9WU38 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms