Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptpn4Q9WU22 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms