Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skp1Q9WTX5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms