Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Phf2Q9WTU0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms