Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trex2Q9R1A9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms