Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed2Q9R0Q3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms