Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod1Q9R0E2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms