Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nek3Q9R0A5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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