Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh2d3cQ9QZS8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sh2d3cQ9QZS8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms