Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nr4a3Q9QZB6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr4a3Q9QZB6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms