Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps29Q9QZ88 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms