Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cbx8Q9QXV1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cbx8Q9QXV1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms