Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip4Q9QXN3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip4Q9QXN3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms