Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChmQ9QXG2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChmQ9QXG2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms