Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms