Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hacl1Q9QXE0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hacl1Q9QXE0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms