Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rai2Q9QVY8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rai2Q9QVY8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms