Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3b2Q9JME5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3b2Q9JME5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms