Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SrfQ9JM73 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SrfQ9JM73 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SrfQ9JM73 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms