Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Thsd1Q9JM61 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Thsd1Q9JM61 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Thsd1Q9JM61 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Thsd1Q9JM61 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Thsd1Q9JM61 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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