Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cabp1Q9JLK7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cabp1Q9JLK7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms