Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Col5a3Q9JLI2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col5a3Q9JLI2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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