Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Tmod4Q9JLH8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod4Q9JLH8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms