Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms