Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tgm1Q9JLF6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgm1Q9JLF6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgm1Q9JLF6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgm1Q9JLF6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgm1Q9JLF6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgm1Q9JLF6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tgm1Q9JLF6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm1Q9JLF6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms